La verdure et les espèces animales ne sont pas seulement dans la zone tropicale, mais aussi le Sahara qui peut les conserver. La faune et la flore très exceptionnelle du Massif de l’Ennedi sont très éloquentes.

L’Ennedi est un écosystème unique au Sahara, un véritable îlot de biodiversité peuplé d’espèces sahéliennes et subtropicales. C’est l’un des derniers environnements de cet immense désert à héberger des espèces qui étaient répandues dans cette zone pendant les premières phases de l’Holocène (époque géologique s’étendant sur les 10 000 dernières années). Il existe une faune et une flore relictuelles, localisées essentiellement dans les gorges et les gueltes. L’exemple le plus éminent est la présence des crocodiles dans la guelta d’Archeï. Ils sont les seuls crocodiles vivant au Sahara à l’heure actuelle, à l’exception d’une population comparable en Mauritanie et en Égypte.